21世(shì )(🤸)纪初，人类将(🙉)多(💪)数人留在被哥斯拉蹂躏的地(🚻)球(🤲)上，仅使(💠)被选中(🏯)的(de )人们(🥕)乘上恒星间(jiān )移民船·阿拉特拉姆，前(💹)往能够移居(👊)的“约(🚗)定之地(dì )·τ星e”。但这一计(🤷)划(🃏)失(🌪)败(bài )，人类只得(dé )再度返回地球。而(ér )长距离(lí )(📧)亚空(kōng )间航行所引发的时空歪曲，导(dǎo )致人(rén )类(🏃)回到的地方(🔎)变成(chéng )了“两(🐖)万年后(hòu )的(de )地(🔥)球”。在这个(🚽)地球，主人公·(👗)晴男(nán )等人在(zài )遭受(shòu )哥斯拉(👩)袭击(jī )的同时，与埃克西弗、比尔沙尔德两种族的(🔮)异星人共(🔬)同实(shí )行(🌲)谋划了(🚪)20年的(💛)“对(duì )哥(gē )斯(sī )拉战术(💨)”，通过(guò )殊死(sǐ )战斗(dòu )成(📯)功(🐇)击(jī )倒了哥(🏗)斯拉。
但喜(xǐ )悦并未(wèi )持续多久，深藏(🌻)地下的(🚰)真正哥斯拉(🈲)“哥(gē )斯拉(🐞)·地球(qiú )”现(xiàn )身(shēn )了。两(liǎng )万年间持续(✒)成(chéng )(🔷)长生(🐋)存、身高300米、质(🌵)量超过10万(🍄)吨，在进(jìn )化成(🥏)这(zhè )种姿态的超巨大哥斯拉(lā )压倒性的(🐖)破(pò )坏力面前，晴男(☕)等人(rén )落花流水(shuǐ )。
拯(zhěng )救了(🏻)晴男的是被(🚱)视为人类的残(cán )存者(zhě )“弗图亚”之民(mín )，米亚娜(😫)。弗(📼)图亚是他们在这个(gè )地球(qiú )首次遇到的人(🎓)型(🐷)生命种族。他们会是人类的子孙(sūn )吗—(👯)—。“弗(🖱)图亚的神也被(🕙)哥(gē )(🛵)斯拉(lā )击破(📫)，如今只(😄)剩(😙)下(👫)卵(💝)。挑(tiāo )战(📎)者、抗争者，全部(🔓)被火焰(🥇)吞(tūn )噬而消(xiāo )失了”面(miàn )对这样的他们，晴男回应道“这是以人类的双手夺回(huí )地(👲)球(qiú )的最后机会了”。
另一(yī )方(🌹)面，比尔沙尔德的(🐹)指挥官(guān )·(💵)加尔(ěr )格，注意到(dào )(🈳)弗图亚使用的箭头(tóu )是(shì )由“自律(lǜ )(🍙)思(sī )(🏢)考金(jīn )(📖)属体·纳米金(jīn )属”所制造而欢喜。这和21世纪他们在富士山(shān )麓作(🍆)为“对(🐆)哥斯拉决战兵器”所开发(fā )、在启动前遭到破坏的“机械哥斯拉”由同(tóng )种(zhǒng )物质所(suǒ )(🌿)构成(🐣)。这(👈)正(zhèng )是(shì )(🍑)当(💑)时的开发设(shè )备至今仍然残存的证明——(🐪)。